Caracterização genômica de profagos provenientes de enterobactérias multidroga resistentes

Abstract

A resistência antimicrobiana é um desafio crescente à saúde pública global, associada a aproximadamente 4,95 milhões de mortes anuais. Evidências sugerem que a emergência de clones bacterianos de alto risco pode estar relacionada à transferência horizontal de genes mediada por profagos. Nesse sentido, este estudo teve como objetivo caracterizar genomicamente profagos integrados aos clones de alto risco de Enterobacter spp., Escherichia coli e Klebsiella spp. Foram utilizadas 57 enterobactérias multidroga resistentes, isolando profagos completos e questionáveis, e avaliando similaridade, classificação taxonômica, anotação funcional, predição de hospedeiro e ciclo de vida através de ferramentas de bioinformática. 242 profagos foram identificados, organizados em 21 agrupamentos filogenéticos distintos, com predominância do ciclo lisogênico, diversidade genética elevada e baixa similaridade com fagos em bancos de dados, sugerindo sequências inéditas. A maioria apresentava tamanho moderado, conteúdo guanina-citosina estável e predomínio de proteínas de montagem viral, infecção do hospedeiro, lise celular e hipotéticas. Ocorreram 50 genes associados à resistência e fatores de virulência, incluindo NDM-1, AAC(6’)-Ib7, sul1, oqxAB, emrE e mdfA, ligados a bombas de efluxo e enzimas inativadoras. Dentre os fatores de virulência, destacaram-se o sistema de secreção tipo VI, pilus comum de Escherichia coli e elementos flagelares, com indícios de disseminação de operons via profagos. Conclui-se que profagos desempenham um papel central na evolução bacteriana, atuando como vetores de inovação genética que ampliam a adaptabilidade, a patogenicidade e o potencial de resistência das enterobactérias frente às pressões seletivas, reforçando a importância da caracterização de profagos como ferramenta complementar no combate à resistência a antibióticos.